Há 06 anos a APAE de Salvador escolheu o Planejamento Estratégico como seu instrumento de gestão. Baseado em princípios e valores que norteiam a filosofia operacional da Instituição, foram identificados seus clientes e beneficiários, e suas áreas operacionais – Centros de Resultado (CR’s), e suas áreas de apoio – os Núcleos de Apoio (NA’s) que, juntamente com as Assessorias Jurídica, Institucional e de Planejamento, formam a Organização Dinâmica Administrativa.

Os Centros de Resultado, nas áreas de educação e saúde, priorizaram o atendimento às pessoas com deficiência mental, objetivo maior de sua Missão. O Planejamento Estratégico se dá a partir das prioridades institucionais e específicas, gerando os Programas de Ação dos CR’s e NA’s, sintetizados nas Gerências Pedagógica, de Saúde e Administrativa Financeira, que irão constituir o Plano de Ação anual, acompanhado do respectivo Orçamento, que vai possibilitar a execução das prioridades ali descritas.