Em dezembro de 2006, a Apae Salvador implantou um novo projeto de comunicação. Fundamentado em estudos e pesquisas, o projeto tem como eixo a atividade de relações públicas, com ênfase na comunicação on line, através das novas tecnologias de informação e comunicação. A proposta é trabalhar a comunicação da Apae com seus públicos, em nível tridimencional: a comunicação institucional, a mercadológica e a interno-administrativa, através de estratégias de webmarketing, mesclando marketing de relacionamento e marketing de permissão.
Ao segmentar os públicos, a organização passou a se relacionar de forma personalizada com cada segmento, melhorando significativamente as relações que estabelecem com cada um deles.
A comunicação, que antes priorizava os meios de comunicação de massa, passou a utilizar instrumentos dirigidos para públicos específicos, apropriando-se das potencialidades das ferramentas disponibilizadas pelas novas tecnologias. É o caso deste Portal de Informações e Serviços, que disponibiliza conteúdos diversos relacionados à instituição e ao tema da deficiência mental. Nele o visitante encontra muitas seções interativas, como o fórum de discussão, enquetes temáticas, dentre outras áreas que possibilitam a sua participação e interação com a comunidade.
A Gerência de Comunicação (Gecom) conta com a seguinte estrutura:
Gerente de Comunicação: Angela Ventura (publicitária)
Assessor Institucional: Tiago Abelardo (Jornalista)
Editoração eletrônica: Leonardo Miranda (designer gráfico).
Estagiário: João Lucas (Relações Públicas)