A área de fisioterapia da Apae Salvador abrange diversas especialidades:

- Estimulação Precoce.

- Fisioterapia Ortopédica, Traumatológica e RPG.

- Fisioterapia Neurológica.

- Fisioterapia Uroginecológica.

- Escolas de Postura para Crianças e Adolescentes e para a Terceira Idade.

A equipe de fisioterapeutas trabalha em conjunto com a equipe médica composta por ortopedistas e fisiatras e conta com tecnologia de ponta para diagnóstico de problemas posturais e da coluna vertebral, a exemplo dos exames:

- Avaliação Postural Computadorizada (APC).

- Baropodometria Eletrônica.

- Goniometria Computadorizada.